温度、水、肥管理是栽培辣椒的核心措施。辣椒不耐高温干旱，也不耐低温和长时间高湿，喜肥又不耐土壤高浓度粪肥，是比较娇性的蔬菜。只有及时的棚室温度调节和均匀供水供肥，才能达到秧果并茂的高产栽培目标。
门椒普遍坐果时秧体还远没封行，特别是地膜覆盖栽培，若白天放风量小，中午前后棚室内气温很可能过高，接近地膜处的气温和土温都很高，能烤坏秧子下部的叶片和近地表的根系，对发秧和结果都不利。
因此，随季节转暖应逐渐加大白天的通风量，进行适温管理。在辣椒秧子封行前，晴天白天仍维持较长时间26 - 28℃气温，最高不能超过30℃，夜间最低气温15℃以上，白天最高土温在25℃以下。秧子封行进入盛果期，对温度适应性渐强，但晴天白天也不能高于30℃。适当降低夜温有利结果，下午闭风不宜过早，但不能低于15℃。如果白天温度过高和夜间温度过低都易落花落果。
门椒坐果后秧果同时生长，需肥需水量逐渐加大，进入了重点迫肥灌溉期，轻施勤施和轻灌勤灌，均匀供肥供水是丰产栽培的肥水管理原则。
辣椒主要靠氮肥增产，一般应在门椒普遍坐果后追一次肥，每亩埯施二铵15 - 20千克，随后轻灌一次水（大半沟水）。5-7夭后轻灌一次水，门椒采收时每亩施尿素10 -15千克并灌水。
以后每隔5-6天灌一次水，每隔10多天追一次肥，每次每亩施尿素15千克左右，都要根据辣椒秧子的长相确定灌溉和追肥的具体时间，以保持侧枝顶端2-3片小叶淡绿色和以下中型及大型叶片正绿色为宜。小叶变正绿色应灌水，其以下的中、大型叶片逐片颜色变淡应施氮肥。
