辣椒（甜椒）苗期、成株期均可受疫病危害，茎、叶和果实都能发病。苗期受害后，茎基部呈暗绿色水浸状软腐，幼苗猝倒或枯萎而死；叶片受害后，病斑近圆形，中央暗褐色；果实受害后，开始在蒂部产生暗绿色水浸状斑，迅速变褐软腐，潮湿时表面长出白色霉层，干燥后形成暗褐色僵果，残留在枝上；茎和枝受害，病斑初为水浸状，后出现环绕表皮扩展的褐色条斑，病部以上枝叶迅速凋萎。
辣椒（甜椒）疫病是由真菌引起的病害，病菌主要在病残体上越冬，病菌经雨水飞溅或灌溉水传到茎基部或近地面果实上，引起发病，在田间可以借雨水传播重复侵染。雨后天气突然转晴，气温急剧上升，病害易流行。易积水的菜地，定植过密，通风透光不良发病重。
主要防治方法：
①选用早熟避病或抗病品种。如选用麻辣、早杂2号、中椒6号、湘研3号、都椒1号细线椒等抗病品种。
②加强田间管理。前茬收获后及时清洁田园，耕翻土地，采用菜粮或菜豆轮作，垄作或坡地种植。培育适龄壮苗，适度蹲苗，定植苗龄以80天左右为宜，株高15-20cm，茎粗0.2cm，80%现蕾。蹲苗后，加强肥水管理，提高抗病力；暴雨后及时排水，严防田间或棚室湿度过高，合理施肥。
③药剂防治。发病前喷洒植株茎基部防止初侵染，田间发现中心病株后，及时用药，防止再侵染。喷洒和浇灌50%甲霜铜可湿性粉剂800倍液、72.2%普力克水剂600-800倍液。夏季高温雨季浇水前每亩撒96%以上的硫酸铜3kg，后浇水，防效明显。棚室保护地选用烟熏法，用45%百菌清烟雾剂，每亩次250-300g，隔9天左右1次，连续2-3次。
