无公害蔬菜生产基地环境检测主要项目包括：农田灌溉水质指标，需检测ph值、汞、镉、铅、砷、铬、氟化物、氯化物、氰化物；加工用水除检测上述项目外，还要检测细菌总数、大肠菌数；大气质量指标需检测总悬浮微粒、二氧化硫、氨氧化物、氟化物；土壤质量指标主要检测汞、铅、镉、铬、砷及六六六、滴滴涕等残留量。
蔬菜产品卫生质量指标需检测磷化物、氰、二硫化碳、砷、汞、镉、氟、六六六、滴滴涕、敌敌畏、乐果、甲拌磷、黄曲霉素b和苯并芘等；叶菜类蔬菜还要检测亚硝酸盐含量。对蔬菜产品中高毒、高残留农药必须检测，并且在生产中绝不允许喷施。
农用灌溉用水标准执行gb5084-92标准，按该标准规定种植蔬菜，生化需氧量（bods）≤80毫克／升；化学需氧量(cod)≤150毫克／升；凯氏氮≤30毫克／升；总磷≤30毫克／升；ph5.5-8.5；全盐，非盐碱土地区≤1 000毫克／升、盐碱土地区≤2 000毫克／升；重金属，如总汞≤0. 001毫克，升、总镉≤0.005毫克／升、总砷≤0.05毫克／升、铬≤0.1毫克／升……；粪大肠杆菌群≤10 000个／升；蛔虫数≤2个，升。
大气环境执行gb3095-82标准，如日平均总悬浮微粒0.5毫克／米3，二氧化硫日平均≤0.25毫克／米3，氮氧化物日平均≤0 .15毫克／米3，一氧化碳日平均≤6．0毫克／米3。
土壤质量标准，通常采用卫生标准，对土壤中六六六残留量标准为0.3毫克／升，滴滴涕为0.5毫克，升。对土壤中重金属元素标准参照英国、德国等标准，汞3毫克／千克，锅1-1.5毫克／千克、砷10-20毫克／千克，铅100 -1 000毫克／千克，铬100 -150毫克／千克。
