上海交通大学:工科类大学,以强大的工学、商学、医学、商学著称,拥有坚实的理学基础,并正在重点发展独具特色的文科类专业。其中工学专业中船舶与海洋工程、机械工程、电子计算机科学与技术、通信工程、生命科学、材料科学等等专业都是实力卓著,国际顶尖。医学中的临床和口腔实力也较强。
南京大学:文理类大学,理学国内顶尖(物理、化学、天文地理等排名最高),在中国语言类学、化学、天文学、物理学、计算机科学与技术、生物学、地质学等领域实力占优,工科、医学较弱。
两所学校综合实力都很强,但各有自己的特色,关键在于偏向文类还是工科类。
