大棚是半永久性的保护地设施，一家一户的大棚面积又有限，栽培西瓜难免连作，而连作枯萎病严重，造成死秧并减产。目前又无特效防治药物，而嫁接育苗栽培能有效预防枯萎病等土传病害，连作几年基本不发生枯萎病，而且瓜秧壮，座瓜率高，瓜长的快，早熟又高产，是值得大力提倡的栽培方式。
嫁接实际上是换根栽培，是利用抗病砧木的根系在地下生长和西瓜的地上植株结瓜。
目前国内优良嫁接砧木有瓠瓜、黑籽南瓜、南砧1号和南砧2号等。接穗宜采用优质、早熟的西瓜品种，如京欣1号等较合适。
靠接法成活率高叉易被菜农学会。靠接法的接穗应比砧木早播几天。播种前用20 - 30℃温水浸泡西瓜种子8-10小时，出水后晾干浮水，用清洁的布把种子包上，在28 -30℃下催芽，芽长近1厘米时播种，播在育苗盘或深10厘米的木箱里，床土与黄瓜相同，覆土厚度1.5厘米左右。播后摆在日光温室内阳光好的地方或大棚中的马粪温床里，盖上地膜，保持土温20℃以上，种芽拱土时掀掉地膜，出苗后待真叶破心时与砧木嫁接。当西瓜种芽拱土时播砧木瓠瓜、黑籽南瓜或南砧1号等。播前用20-30℃温水浸种7-8小时，在26-28℃下催芽，芽长1厘米左右时播种在上口直径10厘米左右的育苗钵里，床土与西瓜相同，盖土1.5厘米厚左右，把育苗钵也排在日光温室内阳光好的部位或大栅内马粪温床里，盖上地膜，保持18 - 20℃土温，种芽拱土时掀掉地膜，待幼苗真叶破心时与接穗嫁接。
靠接开始时先用竹签子把砧木生长点和腋芽挖掉，在子叶下方l厘米处用刀片向下呈30度角斜切砧木茎轴，切口长0.7-0.8厘米，深度达茎粗的一半。再在拔出的西瓜苗子叶以下1.5厘米处用刀片向上呈30度角斜切茎部，切口长也是0.7-0.8厘米，深度达茎粗一半以上。把西瓜苗切口的舌部斜插入砧木切口中，接穗与砧木的茎部表皮至少有一侧对齐，然后用嫁接夹子夹住接口部，并把接穗根系埋人砧木苗钵床土里，然后浇水。嫁接操作技术与黄瓜靠接相似。
